Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms