Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms