Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA6P23229 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA6P23229 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms