Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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CCNA2P20248 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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