Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PGAM1P18669 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGAM1P18669 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms