Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB9P17482 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB9P17482 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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