Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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CTLA4P16410 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTLA4P16410 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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