Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LYL1P12980 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LYL1P12980 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms