Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC239585.2-202ENST00000624629 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 PABPC1P11-201ENST00000428966 2007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 C1GALT1C1-201ENST00000304661 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AL441964.1-201ENST00000454528 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC096659.1-201ENST00000456728 549 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AP002852.2-201ENST00000519630 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC037441.2-201ENST00000522805 898 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC009034.1-201ENST00000568125 669 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC013489.3-201ENST00000623274 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC092329.4-206ENST00000640517 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC011978.1-201ENST00000523386 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms