Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ZBED1O96006 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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ZBED1O96006 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED1O96006 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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