Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACSL4O60488 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACSL4O60488 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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