Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KDELR3O43731 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms