Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms