Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVV-1B6SEH8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms