Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms