Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC23Q9UJX2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms