Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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