Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM30AQ9NV96 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms