Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SMIM3Q9BZL3 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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