Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP2-1Q9BYU5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms