Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP58Q9BVL2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms