Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MCMBPQ9BTE3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms