Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA3CQ99985 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEMA3CQ99985 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEMA3CQ99985 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SEMA3CQ99985 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA3CQ99985 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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