Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RBBP8Q99708 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms