Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCNAQ96QF7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms