Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5RAP3Q96JB5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms