Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C17orf47Q8NEP4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C17orf47Q8NEP4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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