Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms