Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ATG4DQ86TL0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATG4DQ86TL0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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