Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RFPL4BQ6ZWI9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms