Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPOCD1Q6ZMY3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms