Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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