Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EEF1DP3Q658K8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms