Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms