Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EDRF1Q3B7T1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDRF1Q3B7T1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms