Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms