Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRKQ15262 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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