Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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