Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTTNQ14247 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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