Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CBFBQ13951 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CBFBQ13951 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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