Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
FHL3Q13643 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms