Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE3BQ13370 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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