Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB3BPQ13352 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms