Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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GRIK2Q13002 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GRIK2Q13002 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GRIK2Q13002 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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