Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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