Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms