Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PPP3CAQ08209 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms