Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARID5AQ03989 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARID5AQ03989 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms