Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OC90Q02509 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
OC90Q02509 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
OC90Q02509 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms