Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DSC2Q02487 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms